L’institution a été créée en 1971 par Southern Baptist Mission sous le label Pastoral Baptist School. La première vision était de former des pasteurs pour les églises baptistes du Togo. Cette vision a évolué de la scène nationale à la scène internationale depuis 1977 lorsque le nom a changé pour West African Baptist School of Theological (WABST) .La mission était alors de former des pasteurs et des dirigeants pour les églises baptistes à travers l’Afrique de l’Ouest. En 1999, la mission baptiste s’est retirée et les églises baptistes ouest-africaines ont pris le relais. Il leur incombait alors de financer la gestion et le développement. Le premier conseil d’administration formé par les Africains a décidé d’élever le niveau de formation en mettant en place deux programmes: «Baccalauréat» et «Licence en Théologie» (Bth), d’une durée de trois ans chacun. L’école a également été ouverte à toutes les confessions évangéliques. Ces décisions visaient à relever le défi du grand besoin d’une formation de qualité au sein des Églises en Afrique. Depuis 1999, environ 130 personnes de 10 confessions et de 11 pays ont été (ou sont en train d’être) formées dans les deux programmes. Depuis 2008, nous travaillons à diversifier nos programmes de formation: Actuellement, nous avons des programmes de conseil, de développement holistique de l’enfant et de mission. De plus, la plupart de nos cours peuvent être suivis en cours de jour ou en cours du soir. Un régime semi-résidentiel est disponible pour le programme de licence de théologie pour les personnes éloignées et qui ne peuvent pas déménager pour s’installer à Lomé. Ces personnes devront venir sur notre campus deux fois par an pendant sept (07) semaines chaque trimestre. Les programmes de certificats légers sont conçus pour former des chrétiens à divers travaux dans les églises, tels que diriger le culte, la prédication, le tutorat et le ministère des enfants, etc. afin de répondre aux besoins des églises. En 2014, nous avons lancé notre programme d’apprentissage totalement à distance en commençant par le certificat de connaissances théologiques de base (CBTK).