L’institution a été créée en 1971 par la Mission Baptiste du Sud sous le label Ecole Baptiste Pastorale. La première vision était de former des pasteurs pour les églises baptistes au Togo. Cette vision a évolué de la scène nationale à la scène internationale depuis 1977 lorsque le nom a été changé pour Ecole Supérieure Baptiste de Théologie de l’Afrique de l’Ouest (ESBTAO). La mission était alors de former des pasteurs et des leaders pour les églises baptistes de toute l’Afrique de l’Ouest. En 1999, la mission baptiste s’est retirée et les églises baptistes d’Afrique de l’Ouest ont pris le relais. Il leur incombait alors de financer l’exploitation et le développement. Le premier conseil d’administration formé par les Africains a décidé d’élever le niveau de formation en mettant en place deux programmes: « Baccalauréat » et « Licence en Théologie » (Bth), d’une durée de trois ans chacun. L’école a également été ouverte à toutes les dénominations évangéliques. Ces décisions visaient à relever le défi du grand besoin d’une formation de qualité au sein des églises en Afrique. Depuis 1999, environ 130 personnes de 10 confessions et 11 pays ont été (ou sont en cours) de formation dans les deux programmes. Depuis 2008, nous travaillons à diversifier nos programmes de formation: actuellement, nous avons des programmes de conseils, de développement holistique de l’enfant et de mission. De plus, la plupart de nos cours peuvent être suivis sous forme de cours de jour ou de cours du soir. Un régime semi-résidentiel est disponible pour le programme de baccalauréat en théologie pour les personnes qui sont loin et ne peuvent pas se déplacer pour s’installer à Lomé. Ces personnes devront venir sur notre campus deux fois par an pendant sept (07) semaines à chaque trimestre. Les programmes de certificat léger sont conçus pour former les chrétiens à diverses œuvres dans les églises, telles que la direction du culte, la prédication, le tutorat et le ministère des enfants, etc. afin de répondre aux besoins des églises. En 2014, nous avons lancé notre programme d’apprentissage à distance en commençant par le Certificat de Connaissances Théologiques de Base (CCTB).